物流企业的监管部门主要归属于 交通运输管理部门。具体来说，物流公司既可以归交通运输管理局管理，也可以归邮政管理局监管。此外，根据《道路货物运输及站场管理规定》第五条，交通运输部主管全国道路货物运输和货运站管理工作，而县级以上地方人民政府交通运输主管部门则负责组织领导本行政区域的道路货物运输和货运站管理工作。
因此，建议物流企业在具体操作中，可以向当地的交通运输管理部门或邮政管理局进行咨询，以明确具体的监管部门和监管要求。
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