个人所得税扣除社保的原因主要有以下几点：
减轻个人税负：
通过扣除社保费用，可以降低纳税人的应税收入，从而减轻其税负。社保费用通常是工资薪金的一部分，将其从税前收入中扣除，有助于减少应纳税额。
保障低收入者权益：
扣除社保费用后计税，可以让低收入者少缴税款，从而维护他们的权益。
社保缴纳与个税征收对象的关联：
社保缴费基数与个人所得税的征税对象——工资薪金所得紧密相关。因此，将社保费用从工资中扣除，能更准确地反映纳税人的实际收入情况，确保税收的公平性和合理性。
符合法律规定：
根据《个人所得税法》和《社会保险法》的规定，单位为个人缴纳的社会保险费和个人缴纳的部分均可以在计算个人所得税时予以税前扣除。
鼓励社保缴纳：
允许在计算个税时扣除社保费用，可以鼓励个人和企业按时足额缴纳社会保险费，以保障个人和家庭在意外或灾害时的基本生活水平，以及养老退休后的基本待遇。
综上所述，个税扣除社保既符合法律规定，也有助于减轻个人税负，保障低收入者的权益，并鼓励社保的按时足额缴纳。
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