办理健康证的部门主要有以下几种选择：
当地疾病预防控制中心：
这是最常见的办理地点，负责提供预防性健康检查服务，并发放健康证。
卫生行政部门：
部分地区的卫生行政部门也负责健康证的办理，特别是那些经过其审批的医疗卫生机构。
卫生局卫生监督所：
这是另一个办理健康证的部门，负责审核查体结果，对符合条件者发放健康证。
综上所述，办理健康证的主要部门包括 当地疾病预防控制中心、 卫生行政部门和 卫生局卫生监督所。建议选择离自己最近和方便的部门进行办理，并提前电话确认所需材料和流程，以确保顺利拿到健康证。
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