根据最新的信息，自日本回国的中国公民需要准备以下证明和遵守相关政策：
48小时内双阴性证明
必须提供登机前2日内（以采样日期为准）新冠病毒核酸检测阴性证明和血清特异性IgM抗体检测阴性证明。
护照和身份证
合法持有有效的护照和身份证。
遵守当地防疫政策
需要遵守回国当地的地区防疫政策。
留学经历证明
可在回国前到中国领事馆办理留学经历证明。
学历学位认证
提供学位证和毕业证的原件与复印件，以及学习成绩单等。
无犯罪记录和学历证明公证认证
在国内使用日本的无犯罪记录和学历证明时，需要办理公证认证。
其他可能需要的文件
根据具体情况，可能还需要提供其他相关文件，如签证、邀请函等。
请在准备这些文件时，注意查看最新的官方通知和政策更新，以确保符合所有要求。
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