楼顶违章建筑的投诉应该向 城管部门进行。城管部门是城市管理的执法主体，有权对违规建筑进行查处和拆除。
具体投诉方式如下：
电话投诉：
可以拨打12319城建服务热线进行举报。12319是电话投诉中心，电话接通后，电脑系统会记录，并让投诉人留下电话和地址，资料汇总至市城管执法局，城管执法局将给举报违建所在地的属地城管执法局处理。同时，当地城管部门的信访科会给投诉人发回手机短信，告知对方已经办理这一投诉。
书面投诉：
可以通过邮件或现场投诉等方式向城管部门反映问题。
物业和业主委员会：
为了确保投诉的及时性和有效性，还可以向物业、业主委员会等相关部门反映情况，并寻求他们的协助和支持。
建议：
在投诉前，最好先获取相关证据，如照片、视频等，以便更好地协助城管部门进行调查处理。
如果违建行为对自身权益造成了损害，还可以依法向人民法院提起诉讼，要求违建业主排除妨碍、恢复原状或赔偿损失。
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